KPRT Eksplorasi mengelola 17 laboratorium untuk mendukung aktifitas penelitian eksplorasi migas. Daftar laboratorium tersebut adalah sebagai berikut:
• Foraminifera
• Nanoplankton
• Polinomorf
• Komputasi
• Petrografi
• SEM-X Ray
• Core Storage
• Remote Sensing
• Sistim Informasi Geografis
• Topografi
• Geokimia Dasar
• Molekul
• Modelling dan Pengembangan
• Seismik
• Potensial
• Geokomputasi


